四代蛋白质生成模型演进:从骨干生成迈向全可编程蛋白质设计

AllThingsApx · x · 2026-11-05

miangoar 发布 18 推长线程,梳理四个生成式生物分子设计模型的演进(Proteína、La-Proteína、Proteína-Complexa、RFD4-Proteína),判断该领域正走向「完全可编程的蛋白质设计」。配图概括了各代技术路线:Proteína 用非等变 transformer 做大规模 Cα 骨架生成;La-Proteína 通过 VAE 解码器联合生成序列与全原子;Proteína-Complexa 引入目标条件去噪加测试时搜索(以 pAE 和氢键为奖励、剪枝分支)做 binder 设计;RFD4-Proteína 用能量监督解码器加三角更新,跨氨基酸/修饰氨基酸/小分子 RNA 进行推理并做时间步搜索。

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