从头设计感光蛋白：AI 可设计结合视黄醛并随光变构的蛋白质
KevinKaichuang · x · 2026-10-31
分享了一项蛋白质设计工作：利用 LigandMPNN 与 MotifGraft 等计算设计方法，从头设计出能结合全反式视黄醛（all-trans-retinal）的蛋白质，且在光照引起视黄醛异构化后发生构象变化，进而改变与其他肽段的相互作用界面。配套数据显示多个设计（4HB/5HB/6HB/β-barrel 等拓扑）质谱确认视黄醛结合（+266 Da 左右偏移）、可见光区有吸收峰，UMAP 显示设计序列落在天然微生物与动物视紫红质附近的序列空间。这是「光控蛋白-蛋白相互作用」的从头设计案例，属于 AI 蛋白质设计（AI for Science）方向的进展。
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