用 2TB 基因组测试集验证 agent 优化后的代码

jmschreiber91 · x · 2026-10-30

作者介绍其 auto-optimization 流程的最后一环:单元测试覆盖有限,因此最终验证依赖一个约 2TB 的 Genomics Test Suite,包含质量、测定类型、 reads 方向、片段长度、规模各异的基因组实验数据,并为每个数据集构造故意损坏的版本,确保优化后的工具在失败场景下的行为也与原版一致。优化目标是「输出完全一致前提下的运行时间」,这正是单元测试作为一致性门控的意义。

所属事件:AI 优化生信工具链:MACS3 提速最高 60 倍,bowtie2 快 3 倍(4 条相关)→

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