动态负样本微调 ESM2,T细胞结合预测 AUROC 提升 5.22%

bravo_abad · x · 2026-10-29

Zhu 等人在 Nature Computational Science 发表 T 细胞受体–pHLA 结合预测研究,针对「未测过的配对未必不能结合」这一负样本构造难题,提出每个训练批次动态生成全新负样本:排除已知结合对,同时保持各片段在正样本中的出现频率,再用其微调 ESM2 蛋白质语言模型。在 external 实验基准上,相比最强固定负样本基线,3500 万参数模型的 AUROC 相对提升 5.22%,说明固定重排负样本会让模型记住特定挑选方式的偏差。