figwig 也能装单细胞数据：10,246 个 PBMC ATAC 细胞压到 1.0 GB，读块速度碾压 per-cell bigwig

jmschreiber91 · x · 2026-10-28

jmschreiber91 继续展示 figwig 在单细胞实验上的优势：10,246 个 PBMC ATAC 细胞全基因组数据，position 排序的 figwig 文件仅 1.0 GB（track 排序 2.4 GB），写入 4.88 亿个 cut sites 单线程 68 秒、32 线程 36 秒；读 128 个细胞的稠密数据 0.16 秒，而每细胞一个 bigwig 的方案（合计 1.4 GB）同类读取要 0.26-136 秒。核心思路是把多个实验合并进一个数据结构、压缩存储并可按块读出到 DataLoader 风格的对象。