figwig 格式实测：90,543 条 fiber-seq reads 基因组级读写快至 0.42 秒
jmschreiber91 · x · 2026-10-28
jmschreiber91 展示 figwig 数据格式在基因组测序数据上的性能：对 90,543 条 fiber-seq reads（62 MB 文件，每 1,024 条 reads 一 track），单线程写盘 6.8 秒，8,192 窗口全 reads 求和仅 0.42 秒，而 scipy CSR 稀疏矩阵方案（12.7 GB 内存占用）同类操作需 3.8-27 秒。相比传统格式，figwig 把多个实验合并进单一数据结构，文件更小、读写极快。
所属事件:figwig 发布：面向基因组 ML 的多维数据格式(8 条相关)→
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