基因组学数据格式 figwig 发布：将 bigWig 推广到 N 维数组

jmschreiber91 · x · 2026-10-28

作者发布基因组学新数据格式 figwig 及其配套开源库（GitHub, MIT 协议）。figwig 将传统 bigWig 格式泛化到 N 维数组，可高效存储海量 track 集合、单细胞实验、fiber-seq，甚至 Hi-C 和 scHi-C 实验数据。库内置快速多线程读写器，可在 numpy 与文件之间转换；文件格式支持单基因组上任意数量 per-base track，每条带 JSON 属性记录，一次调用即可从任意子集读取窗口数据，输出形状为 (windows, tracks, width)。设计动机：为基因组模型加载训练数据时需读取数万至数十万窗口下的信号，效率关键。