单细胞动力学模型 DynaVelo 发表于 Nature Biotechnology
anshulkundaje · x · 2026-10-23
MSK 团队的 Alireza Karbalayghareh 等人在 Nature Biotechnology 发表 DynaVelo：一个基于神经常微分方程（neural ODE）的生成式动力学模型，从单细胞多组学（multiome）数据中联合学习基因表达与转录因子 motif 活性的动态演化。
- 与只画轨迹的方法不同，DynaVelo 学出向量场的函数形式，可在 in silico 中直接扰动模型做假设检验
- 模型复现了小鼠生发中心（GC）B 细胞的体内分叉动力学，并揭示 Arid1a、Ctcf 杂合缺失如何改变这些动力学
- 能预测 B 细胞中的 loss-of-function 及 rescue 扰动结果
论文与代码均已开放。
所属事件:MSK 团队 Nature 子刊发文：DynaVelo 用神经 ODE 预测细胞命运逆转(2 条相关)→
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