LLM 智能体整合五大数据库，构建人类表面蛋白质组开放图谱
anshulkundaje · x · 2026-10-21
Surfaceome v1.3.0：LLM 智能体构建的蛋白图谱
人类约 10–20% 的蛋白会到达细胞表面，但 65% 以上的已批准药物靶向这些分子——因为药物无需进入细胞即可起效。然而 UniProt、GO、Human Protein Atlas、Cell Surface Protein Atlas 和 SURFY 五大公共数据库对"表面蛋白质组"的定义和方法各不相同，结论分歧多于一致。
Deliverome 项目的 Surfaceome 图谱用 LLM 分诊智能体对每个人类编码蛋白基因进行打分，再由 deep-dive 智能体为强候选基因汇编证据（表面定位方法、抗体验证、异构体拓扑、可及性注意事项），生成逐基因记录。
结果按置信度分层：Canonical（1,783 个高置信表面蛋白）、Likely（1,252 个更广集合）以及 Cell-state induced、Cell-type restricted 等子类。全部开放访问、证据可溯源，且为 agent-readable，可通过 API 查询过滤定义。
所属事件:五大蛋白库仅188条一致，团队用Claude构建开放表面组图谱(4 条相关)→
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