完全在打包空间运算:1 万窗口 shuffle 从 7.86s/8.7GB 降至 0.85s/0.7GB
jmschreiber91 · x · 2026-10-20
当整个流程完全在打包空间(packed space)运算后,对 1 万个窗口做双核苷酸 shuffle 的耗时从 7.86s 降到 0.85s,内存占用从 8.7GB 降到 0.7GB。
作者指出这个量级已经不太可能成为任何机器的内存瓶颈,同时也顺带解决了原先无关的性能下降问题。
所属事件:tangermeme 推出 PackedSequence：2bit 打包让基因序列内存省16倍(6 条相关)→
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