David Baker 团队从头设计半胱氨酸蛋白酶登 Nature,哺乳动物细胞内验证活性
DaveJuergens · x · 2026-10-19
- Baker 实验室（David Baker 通讯）在 Nature 发表半胱氨酸蛋白酶的从头设计（de novo design）论文：团队设计了全新的蛋白折叠，能切割肽键（酰胺键），突破了以往 de novo 酶设计仅限于低能垒模型反应的限制。
- 设计流程基于输入催化基序（Cys-His-Asp 三联体），经 RFdiffusion 类方法生成骨架并筛选，设计成功率约 19%（13/69 实验表征的设计中观察到切割活性）。图示涵盖平行/反平行/三明治 β 链对等不同骨架拓扑。
- 得到的酶（如 Gawi、Kal、Dokki）在哺乳动物细胞中展示了切割活性——实验用 de novo 酶切割带 mScarlet 报告标签的底物蛋白验证。论文与代码均已公开。
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