OpenADMET PXR 结构预测挑战复盘：共折叠找对构象依然很难
anshulkundaje · x · 2026-10-17
OpenADMET 挑战赛结构赛道复盘文章，针对孕烷 X 受体（PXR）这一药物研发中的关键毒性靶点——意外激活 PXR 会上调 CYP3A4 等代谢酶，是药物开发的重要风险。
核心内容
- 基准测试基于 184 个未发表的新晶体结构，近 100 支团队参赛盲测；PXR 结合口袋异常大且高度柔性和混杂，一直是结构计算方法的难点。
- 顶级提交结果揭示了几个关键教训：共折叠（co-folding）架构虽已主导蛋白-配体结构预测，但找到正确结合姿态（pose）依然困难；微调策略与基于物理的力场在姿态排序上持续占优。
- 文章是系列第二部分，此前第一部分复盘了活性赛道（预测 PXR 诱导，测试集充满活性悬崖）。
- 全文 32 分钟阅读，作者为 Maria Castellanos、Jon Swain 和 Hugo MacDermott-Opeskin。
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