AI 自动优化让生信工具 MACS3 提速 41-64 倍，Claude Code 生成经人工审核合并
jmschreiber91 · x · 2026-10-16
MACS3（经典 ChIP-seq 峰值 calling 工具）的 auto-optimize PR 已合并：- 提速：四组默认 callpeak 运行（BAM、FRAG、含 control 的 BAM、BAMPE）实测 41-64 倍加速 - 手法：C 循环重写热点代码、按染色体 fork 进程池并行、多线程 BGZF 解压 - 验证：输出与 main 分支字节级一致，另跑 27,122 次各子命令回归对比；基于先合并的 #755 单元测试套件 - 由 Claude Code 生成、人类审核，作者致谢 Anthropic AI for Science 项目的支持。
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