EPFL 用 RFdiffusion 设计变形蛋白,单序列可折叠两种构象
ferruz_noelia · x · 2026-10-16
EPFL Correia 团队在 bioRxiv 发布研究,通过计算设计出全新的「变形蛋白」(metamorphic proteins):同一序列无需外部触发即可在两种充分折叠的构象间切换,把蛋白质设计从单一静态结构推向可控制的构象景观。
关键方法与发现:
- 从 93 个 60–150 aa 的天然小结构域出发,用 RFdiffusion 部分重塑末端、固定核心,每个结构域生成 200 个备选构象,筛选 RMSD>4 Å 且二级结构变化≥40% 的构象对
- 重要观察:较大的结构变化只需相对少量的序列改变——不少备选态设计与天然蛋白序列同一性仍>50%,而结构差异可达约 16 Å RMSD
- 通过「态定义突变」可将能量景观推向 State 1 或 State 2,实现对构象的可控偏置
展示了 AI 辅助蛋白质设计从「设计一种结构」走向「设计能量景观」的路径。
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