Prompteina:首个文本条件全原子蛋白质结构生成模型
PangWeiKoh · x · 2026-10-14
Prompteina 被介绍为首个文本条件的全原子蛋白质结构生成模型,可直接从自然语言提示同时生成氨基酸序列和全原子 3D 结构,用统一的语言接口取代逐属性工程化的条件输入。
关键贡献:
- Prompteina-Data 数据集:约 180 万条蛋白质链结构数据(来自 PDB、AlphaFold DB 及合成二聚体),配以 5240 万条 LLM 撰写的描述(平均每结构约 29 条),涵盖最多 59 类标注。
- 细粒度残基级约束:描述不止高层功能概述,还包括二硫键、催化位点、蛋白-蛋白接触等残基级对应关系。
- 展示案例包括小分子结合剂设计、多折叠束、α-β 桶等结构从文本直接生成,并附亲和力(如 KD 68.8 nM)等实验证据。
所属事件:Prompteina 问世：自然语言直接设计全原子蛋白质(4 条相关)→
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