Hugging Face 开源 Carbon-A:12 亿参数 DNA 模型标注基因编码区

lmoroney · x · 2026-10-12

lmoroney 介绍 Hugging Face 新发布的开源模型 Carbon-A-1.2B(Apache 2.0),用于标记真核基因组中编码蛋白质的碱基:- 将 DNA 切成六字母 token,每次读取 98,304 个碱基对的窗口;- 设两个分类头分别对应两条链,可捕捉反向链上重叠的编码区;- 训练数据来自哺乳动物、植物、真菌等 2,055 个 RefSeq 组装,注释管线为每个预测基因给出置信度分数;- 可通过 Transformers + PyTorch 加载。模型卡附带酵母基因组复现教程,核苷酸 F1 达 0.998。

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