Calico 开源 Cerberus 基因组模型:786kb 输入预测 8000+ 轨迹,迁移 PyTorch
anshulkundaje · x · 2026-10-10
Calico 实验室发布 baskerville 仓库,开源 Cerberus 及其前代 Borzoi、Borzoi Prime 的 PyTorch 预训练模型,许可证为 Apache 2.0。
- Cerberus 用双向状态空间(Hydra)模块替换 Borzoi 的 transformer,单次读取 786kb DNA 序列,以 32bp 分辨率预测 8,361 条人类与 3,102 条小鼠功能基因组轨迹,覆盖 RNA-seq、CAGE、DNase/ATAC、ChIP、CLIP 等
- 团队同时将整个软件基础设施从 TensorFlow 迁移到 PyTorch,以便与主流生态和应用代码兼容
- 官方称 Cerberus 比 Borzoi 更准确且推理成本更低
所属事件:Calico 开源基因组模型 Cerberus,多组学基准全面超越 Borzoi(2 条相关)→
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