斯坦福 kundajelab 开源 GPU 加速 motif 分析工具 MotifCompendium
anshulkundaje · x · 2026-10-05
斯坦福 Kundaje 实验室发布 MotifCompendium V1.0：一个 GPU 加速的序列 motif 分析框架，可大规模比较、聚类、注释、过滤和分析 DNA 序列 motif。
- 配套 ENCODE GRAMMAR（基因组调控图谱）与 ENCODE MotifCompendium（统一的预测性 motif 集合），有技术说明文档
- 团队表示在内部充分验证后尽早发布，从 DeepMind 团队等外部用户处获得大量反馈，修复了边界情况 bug 并新增功能；新版即将发布
- 代码与教程开源在 GitHub
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