ENCODE 发布逾2万组实验的基因调控参考图谱预印本
anshulkundaje · x · 2026-10-04
ENCODE 项目联盟在 bioRxiv 发布最新预印本，公开征集基因组学界批评反馈。
- 规模：20 多年积累的逾 16,000 项全基因组实验，主要基于原代细胞与组织。
- 调控元件目录：530 万个 DNase I 超敏位点，勾勒出人类基因组中几乎所有染色质可及的调控 DNA；另含染色质状态、转录因子占位、新生转录图谱，以及非编码变异对调控元件活性影响的系统预测。
- 基因与转录本：新增近 18,000 个新型人长链非编码 RNA 基因、近 150,000 种新型转录本异构体，以及跨细胞类型和时间的转录本稳定性全基因组图谱。
- 调控互作网络：在 100 多种人体组织与细胞系中，以最高 10 bp 分辨率绘制调控元件与基因间物理和功能互作，连接数百万个 loop anchor 与基因表达。
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