开源 mhctools 一个 predict() 调用统一十余个免疫预测器
iskander · x · 2026-10-02
作者开源了 mhctools 库,将 NetMHCpan、MHCflurry、Pepsickle、DeepTAP、PRIME、BigMHC 等大量 MHC 结合/呈递/免疫原性预测器封装进统一的 predict() 接口。换用不同预测器只需改一行代码,对比结果可输出为 DataFrame。文档还按用途分类(结合亲和力、表面呈递、蛋白酶切割、T 细胞响应、TCR 识别等)列出全部预测器矩阵,并提醒部分模型实际表现弱于其论文声称,附 RandomBindingPredictor 作为零基线。pip install mhctools 即可上手。
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