耶鲁等团队发布 Pop-Corn,预测基因扰动对细胞群体构成的影响
burny_tech · x · 2026-09-28
- bioRxiv 预印本 Pop-Corn(耶鲁、宾大、Whitehead 研究所合作)研究 Perturb-seq 等混合单细胞筛选中的核心难题：如何预测未见过的基因扰动引起的细胞类型与状态构成变化。
- 指出现有扰动预测方法多优化平均基因表达响应，再下游推断细胞构成；作者发现即便准确预测平均表达变化的模型，在预测群体构成偏移上也可能失败。
- Pop-Corn 直接以构成变化为预测目标，覆盖单细胞与空间语境，可扩展到实验无法穷举的扰动组合。
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