Tsallis熵推广Fst统计量,Fq可按等位基因频率调谐

anshulkundaje · x · 2026-09-18

斯坦福团队在 IEEE ICASSP 与 arXiv 发表论文，提出基于 Tsallis 熵的固定统计量推广 $Fq$：衡量亚群体内 Tsallis q-熵损失占混合群体的比例。该族在 q=2 时退化为经典 Fst，q=1 时为香农熵类似物；低 q 强调稀有变异，高 q 强调常见变异，在等位基因频谱偏斜时提供比 Fst 更细粒度的群体分化视角。

在 865 个大洋洲基因组（182 万位点）及基于 HGDP/1000 Genomes 1432 个创始者的谱系模拟（32 万位点）上，OVR 与 LOO 模式可清晰归因驱动区域结构的亚群，并灵敏地定位隔离-迁移事件与创始者效应的时间。