David Baker 团队新作:从头设计变构开关控制的酶
DaveJuergens · x · 2026-09-16
David Baker 实验室新预印本提出一种通用的从头设计策略,构建催化活性可被远程开关的紧凑酶:
- 核心思路:设计两个邻近构象状态——催化残基几何最优的活性态、活性位点轻微畸变的失活态;再设计一个效应蛋白在远端位点结合,选择性稳定其中一种状态,从而实现激活或抑制,模拟天然变构而无需结构域融合或大幅机械重排。
- 方法创新:用部分 RFdiffusion(对起始骨架加约 1–3 Å 高斯噪声再去噪)生成接近起始折叠的替代主链构象,富集细微但功能性的构象变化。
这是蛋白质设计从「造出能催化的酶」迈向「造出可调控的酶」的标志性进展,属于 AI for Science 的实质突破。
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