跑 1 亿次 Boltz-2 共折叠,Recursion 研究员构建最小虚拟细胞
HannesStaerk · x · 2026-09-14
Recursion 的 Dominique Beaini 撰文介绍其 12 个月的实验:用抢占式 GPU 跑了 1 亿次 AlphaFold Multimer / Boltz-2 蛋白质共折叠与亲和力预测,覆盖 9000 个独特靶点和 50 万配体,构建了名为 affinity-prints 的数据集。
- 难点不在跑量,而在判断哪些预测相互作用在细胞内真正重要——借助 Recursion 的大规模表型组(phenomics)数据来关联 affinity-prints 与细胞实验数据。
- 关键成果:仅用 6 个参数构建了「最小虚拟细胞」,通过稠密 affinity-prints 与 Recursion 生物学图谱耦合即可估计表型相似度图谱;另创建了数据驱动的配体评分方法 Lig2Cell 评估配体细胞效应。
- 这是 AI for Science 方向将结构预测模型规模化用于细胞生物学模拟的代表性尝试。
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