NVIDIA BioNeMo 推理 Runtime 公测,Boltz-2 吞吐提升近 3 倍
AllThingsApx · x · 2026-09-10
NVIDIA 推出 BioNeMo Inference Runtime 公开测试版，一个开源、PyTorch 原生的库，用于在 NVIDIA GPU 上加速生物分子结构预测推理。
要点：
- 提供 end-to-end 处理管线：解析、tokenization、特征生成、GPU 推理到 PDB/mmCIF 输出，也可作为 PyTorch 模块直接集成。
- 优化分三层：kernel 选择、CUDA Graph 捕获的模块优化、基于 Ray 的多 GPU 副本流水线扩展。
- 在 8xH100 上对 1000 个人源二聚体靶点的对等基准中，加速版 Boltz-2 达到每 GPU 小时 58.5K 成功折叠残基，对比 torch.compile 开源实现的 20.2K，残基归一化吞吐提升 2.90 倍。
- 能耗方面，折叠 100 万个可比靶点估算能耗 BioIR 为 11 MWh，公开实现为 35 MWh。
- 支持 Boltz-2、OpenFold2、Protenix v2 等模型，合作方包括 apheris、SandboxAQ、Xaira 等多家机构。
所属事件:NVIDIA 开源 BioNeMo 推理运行时，加速生物分子结构预测(5 条相关)→
「Infra」频道最新
- d-Matrix 接入 NVIDIA NVLink Fusion，Raptor XPU 走机架级推理路线 — BenBajarin · 2026-09-11
- AI 芯片创业公司 dMatrix 抉择：只做计算，其余交给英伟达 — BenBajarin · 2026-09-11
- DeepSeek v4.1 Flash 翻倍大却没翻倍聪明，本地部署更适合小杯 — QuixiAI · 2026-09-10
- 34GB 视频 DiT 双 3080 静态分片：告别 DisTorch 崩溃还更快 — Responsible_Art7438 · 2026-09-10
- 播客解读中国 Agent 监管新规与 Baseten 最新动态 — The Cognitive Revolution · 2026-09-10
- NVIDIA 开源 BioNeMo 推理库,曾为 AlphaFold 数据库省下大量算力 — AllThingsApx · 2026-09-10