NVIDIA Parabricks HaplotypeCaller 入驻 nf-core/sarek,胚系变异检测全面GPU加速
AllThingsApx · x · 2026-09-04
NVIDIA 宣布其 Parabricks HaplotypeCaller 已正式进入 nf-core/sarek —— 一个被广泛采用的胚系基因组分析流程（v3.10.0）。
- nf-core/sarek 用于从全基因组/靶向测序数据中检测胚系或体细胞变异，涵盖预处理、变异检测与注释，基于 Nextflow 构建，支持任何有参考基因组的物种。
- 此前 Sarek 已集成 Parabricks 加速的比对环节；此次更新使胚系变异检测（HaplotypeCaller）同样可用 GPU 加速，全流程算力效率进一步提升。
- 用户可通过 nf-core 官网直接试用 3.10.0 版本。这是 GPU 加扩基因组学标准开源工作流的又一落地案例。
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