新框架用 ML 演化酶实现全立体异构体合成
bravo_abad · x · 2026-08-25
Zhenyu Lu 等人在 Nature Synthesis 发表论文，展示了如何利用机器学习引导蛋白质工程，将一种醇脱氢酶进化为能生成含三个手性中心的所有八种立体异构体的酶系。
技术方案 (BioStrucTag)：
- 结构分支：将三维催化口袋表示为体素化的配体-酶复合物，让模型学习与特定立体化学结果相关的结构特征。
- 序列分支：整合来自基于 Transformer 的蛋白质语言模型的序列信息。
- 协同工作：两者结合优先考虑突变，无需穷举筛选，大幅缩小实验搜索空间。
结果：生成的变体可覆盖所有八种可能的立体异构体，对映体比和非对映体比均达到 99:1。
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