生信工具 FasterFASTA：多线程解压提速明显
viglovikov · x · 2026-08-21
Rust 编写的生物信息学命令行工具 FasterFASTA 发布，用于处理 FASTA/FASTQ 文件。核心优化点在于将解压缩器内置于工具内部，而非通过 Unix Pipe 上游处理，从而实现多线程并行解压。测试数据显示，支持块级独立解码的 .bgz 格式在 8 线程下吞吐量达 1.69 GB/s，远超单流模式的 .gz 和 .zst。
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