新平台 PUREdrop 自动化合成细胞以筛选设计蛋白
bravo_abad · x · 2026-08-17
Kareem Al Nahas 等人介绍了 PUREdrop，这是一个自动化微流控平台，用于在数千个皮升级合成细胞内表达计算设计的蛋白质，并通过延时显微镜进行追踪。
- 背景：蛋白质设计进展迅速，但当目标是时空中的涌现行为而非结合或催化活性时，筛选设计蛋白变得困难。
- 计算设计：研究从细菌细胞分裂蛋白 FtsZ 开始，保护 GTP 结合、聚合和进化保守相关的残基，使用 ProteinMPNN 重新设计其余部分，并利用 AlphaFold2 预测筛选出 24 个变体。
- 自动化测试：PUREdrop 从微孔板中获取 DNA 构建体，在合成细胞中进行表达和观察，解决了高通量功能筛选的瓶颈。
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