AIR-seq 用标准 RNA-seq 追踪 RNA 合成与降解
lpachter · x · 2026-07-29
AIR-seq 用标准 RNA-seq 直接读出新旧 RNA 动态
传统 RNA-seq 只能告诉我们细胞里有多少 RNA，看不到决定这些丰度的合成速率和降解速率。这篇 bioRxiv 论文提出了 AIR-seq（analog intrinsic recoding sequencing），利用 N4-hydroxycytidine, NHC 的碱基配对特性，在标准 RNA-seq 文库里把新合成 RNA 标记成 C-to-T 和 T-to-C 错配信号。
- 不需要化学转换，也不需要富集步骤。
- 可以同时解析群体和单细胞 RNA 动态。
- 有助于提升 RNA velocity 推断。
- 能揭示传统稳态丰度测量看不到的调控信息。
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