AlphaGenome 开始被微调到覆盖轨迹之外的 RNA-seq 模态

anshulkundaje · x · 2026-07-29

这篇 genomicsxai 博文介绍了一个用于 AlphaGenome 的微调框架，目标是把模型适配到多种 RNA-seq 模态，包括基因表达、剪接位点使用和剪接连接（splice junctions）。

作者详细说明了整个流程：数据预处理、数据加载、调试与在留出基因区间上的评估。研究动机是让 AlphaGenome 适应预训练阶段没有见过的 RNA-seq 样本，从而学习样本特异的多模态转录组模式。文中还用 SF3B1 K700E 癌症驱动突变样本与野生型样本做案例，因为该突变会影响剪接并促进隐蔽剪接位点的使用。