单细胞多组学揭示阿尔茨海默病的 3D 基因组变化

jmuiuc · x · 2026-07-26

单细胞多组学把阿尔茨海默病与 3D 基因组变化连起来

这项研究把多种数据模态整合到一起，研究阿尔茨海默病，包括：

• GAGE-seq（Hi-C + RNA）
• snATAC-seq
• Xenium
• 多尺度整合分析与预测建模

图中给出的核心结论是：

• 在 AD 中，compartment mingling 增强
• regulatory architecture 发生变化，短程与中程调控模式都出现重构
• 最终带来基因表达的改变
• 分析框架把 3D genome features、gene regulation programs 和 spatial organization 连接了起来

图里还展示了 Hicformer 用 DNA 序列加 3D 特征来预测基因表达，并结合空间转录组分析微环境和配体-受体互作。

所属事件:Science 揭示阿尔茨海默病单细胞 3D 基因组重组(4 条相关)→

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