单细胞多组学揭示阿尔茨海默病的 3D 基因组变化
jmuiuc · x · 2026-07-26
单细胞多组学把阿尔茨海默病与 3D 基因组变化连起来
这项研究把多种数据模态整合到一起,研究阿尔茨海默病,包括:
- GAGE-seq(Hi-C + RNA)
- snATAC-seq
- Xenium
- 多尺度整合分析与预测建模
图中给出的核心结论是:
- 在 AD 中,compartment mingling 增强
- regulatory architecture 发生变化,短程与中程调控模式都出现重构
- 最终带来基因表达的改变
- 分析框架把 3D genome features、gene regulation programs 和 spatial organization 连接了起来
图里还展示了 Hicformer 用 DNA 序列加 3D 特征来预测基因表达,并结合空间转录组分析微环境和配体-受体互作。
所属事件:Science 揭示阿尔茨海默病单细胞 3D 基因组重组(4 条相关)→
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