单细胞基础模型Tabula

anshulkundaje · x · 2026-07-16

这条转发介绍了一篇关于单细胞基础模型 Tabula 的研究：它把细胞数据直接表示为表格，而不是人工构造的基因序列，并支持隐私保护的联邦训练。

作者称，Tabula 不仅提升了预测性能，还能恢复多个发育系统中经过实验验证的基因调控组合逻辑。团队还用自建的可诱导 Perturb-seq 系统做了实验，发现 Oct4 和 Sox2 会如模型所预测那样降低衰老成纤维细胞的年龄评分；同时，模型提出的 Cpe、Postn、Olfm2 等候选因子与重编程因素作用互补，扩展了可行的细胞重编程策略空间。